ウイルス禍2020年末 新型コロナ(12月26日)

 今年はコロナウイルス世界席捲の1年だった。
 当ブログも1月の「新型肺炎注意報」から始まって、今回で「その15」ないし「その17」。

 12.26時点で、世界全体の感染者7991万人超(うち4506万人超が回復)・死者175万人超。
 10.6から約2ヶ月間で感染者数が激増(2倍超)。伴って死者も増えている。

 感染者数は、
 U.S.A. ・・・ 1876万人超
 India ・・・ 1016万人超
 Brazil ・・・ 744万人超
 Russia ・・・ 299万人超
 France ・・・ 260万人超
 U.K. ・・・ 222万人超
 Turkey ・・・ 211万人超
 Italy ・・・ 202万人超
 Spain ・・・ 185万人超
 Germany ・・・ 163万人超
 Colombia、Argentina ・・・ 157万人超
 Mexico ・・・ 137万人超
 Poland ・・・ 125万人超
 Iran ・・・ 118万人超
 Ukraine ・・・ 104万人超
 Peru ・・・ 100万人超
 South Africa ・・・ 98万人超
 Netherlands、Indonesia ・・・ 70万人超
 Czech、Belgium、Romania ・・・ 60万人超
 Chile、Iraq、Canada、Bangladesh ・・・ 50万人超
 Pakistan、Philippines、Switzerland、Morocco ・・・ 40万人超
 Sweden、Israel、Portugal、Saudi Arabia、Austria、Serbia、Hungary ・・・ 30万人超
 Jordan、Nepal、Panama、Georgia、日本、Azerbaijan、Ecuador、Croatia、U.A.E. ・・・ 20万人超
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 ※ ジョンズ・ホプキンス大学 Coronavirus Resource Center(coronavirus.jhu.edu/

 ヨーロッパなど比較的落ち着いていた地域で秋以降再びぶり返している。
 アジアではIndiaが群を抜いており、Iran、Indonesiaも悪い。

 死者数は、
 U.S.A. ・・・ 33万人弱
 Brazil ・・・ 19万人超
 India ・・・ 14万人超
 Mexico ・・・ 12万人超
 Italy、U.K. ・・・ 7万人超
 France ・・・ 6万人超
 Iran、Russia ・・・ 5万人超
 Spain、Argentina、Colombia ・・・ 4万人超
 Peru ・・・ 3万人超
 Germany、Poland、South Africa、Indonesia ・・・ 2万人超
 Turkey、Belgium、Ukraine、Chile、Romania、Canada、Ecuador、Iraq、Netherlands、Czech ・・・ 1万人超
 Pakistan、Bolivia、Philippines ・・・ 9000人超
 Hungary、Sweden ・・・ 8000人超
 Bangladesh、Egypt、Morocco、Switzerland、Bulgaria ・・・ 7000人超
 Portugal、Saudi Arabia ・・・ 6000人超
 Austria ・・・ 5000人超
 China、Guatemala、Greece、Tunisia ・・・ 4000人超
 Bosnia and Herzegovina、Panama、Jordan、Croatia、Israel、Honduras、日本 ・・・ 3000人超

 2月の時点でスマートなウイルスだと思ってはいたが、『世界人口の2/3が感染する可能性がある』という推測が当たりそうな勢い。
 今冬は昨冬より悪くなるのが確実になってしまったので、結局ワクチン頼み。

ウイルスの変異

 U.K. ロンドンを含む南東部で感染力の強い変異種(正しくは変異株)が現れたという知らせ。9月頃現れたらしい。
 秋から日本含め世界各地で感染が再拡大しているので、感染力が強くなっていること自体驚きではないが、もっと感染力が強いようだ。South Africaで現れた変異株も感染力が強いという。

 ネクストストレイン Nextstrain(nextstrain.org)」の系統樹で、
 20B/501Y.V1の枝がU.K.の変異株。
 20C/501Y.V2の枝がSouth Africaの変異株。
 日本のデータは多くないが、秋以降、20Bの枝に散見。「欧州型」と呼ばれている一群からの派生。

 下図は国立感染症研究所 「新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査(2020年10月26日現在)」のページから。

 昨冬、日本で最初に入ってきたウイルスが「China ブカン(武漢)型」で、今は消失。
 3月~5月の「波」は、Italyなどヨーロッパから世界中に拡がり、日本にも入ってきた「欧州型」。
 いったん終息(収束)に向かっていった後のぶり返しの「波」(7月下旬~8月上旬がピーク)は、東京の新宿~池袋あたりからじわじわ拡がっていった。一部で「東京型」などと呼ばれているが、「欧州型」からの派生。

 7月以降、日本で検出されている多くの検体は、2つの「欧州型」派生群に集約される、とのこと(上図赤色)。
 細かな点までは分からない。

 「欧州型」および日本でみられる「欧州型」派生群は、みなD614G変異。
 ウイルスのS(スパイク蛋白質 Spike Protein)の翻訳アミノ酸配列 translationの614番目がD(アスパラギン酸)からG(グリシン)に変異したもの。

 ネクストストレイン、アミノ酸配列については以前少しとりあげた。

 変異速度は24.7[塩基変異/ゲノム/年]。
 およそ1ヶ月で2塩基、およそ半月で1塩基が変わっている。
 終息するまでコロコロ変わっていく。

 系統が違うが、U.K.の変異株もSouth Africaの変異株もN501Y変異。
 ウイルスのS(スパイク蛋白質)のアミノ酸配列の501番目がN(アスパラギン)からY(チロシン)に変異。
 異なる進化なのに同じように変異する---。

 U.K.の変異株は、
 実効再生産数を0.4以上増加させ、
 感染力は最大7割増加(最大1.7倍)。
 既にDenmark、Belgium、Netherlands、Italy、Australiaなどでも確認されている。
 日本上陸も時間の問題だろう、と書こうとしたら早くも確認の知らせ。
 12.24以降、日本人帰国者以外U.K.からの入国停止が決まって、12.25、空港(羽田と関空)にて複数の帰国者から初確認。
 こりゃ、既に入り込んでいる可能性濃厚。

 感染力が強いといっても従来どおり飛沫感染、エアロゾル感染まで。個人レベルでは対策強化しようがないから今までどおり。
 これまでより子供が感染しやすくなると言われているので、子供から大人へ感染するパターンが増えそう。

 病原性が高くなっているわけではなさそうだから、怖がりすぎる必要はないが、甘く見てもいけない。
 日に日に感染者が増えて医療機関が逼迫してくると重症者・死者も増えてくる。

 今月上旬、状況が悪かったのは大阪、北海道、愛知。なかでも大阪は、
 GoogleのCOVID-19 感染予測
で年末1000人超になっていた。
 あくまでも予測なので対策すれば食い止められる。今のところ。
 本日の感染者数:大阪299人、愛知265人、北海道161人。

 カウントダウンではなくカウントアップしているのが、
 東京949人、神奈川480人、埼玉265人、千葉201人、……。
 カントウダウン。ガーン。

 政府は「勝負」に負け。TKO。
 Go Toがウイルスを下支えして「行け」から「逝け」になり、
 たたきあげの令和おじさんは袋だたき。

 あらためてスマートなウイルスだと思う。

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